Door het terugdringen van nematiciden moeten bietencysteaaltjes steeds meer worden beheerst met resistente bietenrassen. Het verlagen van het besmettingsniveau kan door het aanbrengen van antagonisten, waarvan Verticillium chlamydosporium de meest effectieve is. De meeste wortelknobbelaaltjes zijn ook gevoelig voor deze antagonisten. Het blijft de vraag of opschalen van de productie van V. chlamydosporium economisch haalbaar is.